Apps For Science

A very subjective list of applications that make doing science easier.
Plus some random references.

Collecting scientific papers and bibliography

http://www.mendeley.com/
(no further comments, just it saved a lot of my time and stress)

Internet collaboration (and learning LaTeX by example)

LaTeX without installing anything; starting with example you can modify (and preview):
https://www.writelatex.com/
To collaborate just send link - no need to login!

I will translate rest of it - later
(but it should be self-explanatory anyway)

Edytor tekstu i kodu (w tym - LaTeXa)

Jest wiele fajnych edytorów stricte LaTeXa, ale niedawno przekonałem się, że są edytory do wszystkiego.
Jeden z nich to jest Vim - na wielu rzeczach Unixowych domyślna przeglądarka.
http://www.vim.org/download.php
Niby początki są ciężkie (nie wiadomo nawet jak wyjść), ale wystarczy wpisać w lini poleceń:
vimtutor
albo… http://vim-adventures.com/

Zaś obecnie używam Sublime Text 2
http://www.sublimetext.com/
zarówno do kodzenia, jak i pisania prac w LaTeXu (do tego wtyczka: https://github.com/SublimeText/LaTeXTools), jak i do pisania notek.
B. polecam!

Obie są dość potężne, i szybkim skrótem można zrobić cokolwiek (od zakomentowania wybrenego tekstu, przez skasowanie dokłądnie 5 linii, do "go to" dowonlej sekcji pliku, czy też podopowiadania kodu).

Kontrola wersji

Dlaczego warto używać kontroli wersji:
http://academia.stackexchange.com/questions/5277/why-use-version-control-systems-for-writing-a-paper

Z obecnie najlepszych programów są Git (http://git-scm.com/, tutorial dot. LaTeXa, ale nie tylko: https://www.sharelatex.com/blog/2012/10/16/collaborating-with-latex-and-git.html) i Mercurial (http://mercurial.selenic.com/, tutorial: http://hginit.com/). Ja używam Gita, ale np. na Windowsie pewnie łatwiej mieć Mercuriala.

Oba programy działają bardzo dobrze, gdy są tylko na naszym komputerze. Niemiej, czasem chcemy czy to backupować projekty, czy też podzielić się ze wspólpracownikami (lub - światem).

Do tego służy https://github.com/ (Git) i https://bitbucket.org/ (Git i Mercurial). W tym drugim jak się pokaże maila uczelnianego, to dostanie się za darmo nieograniczoną liczbę repozytoriów:
http://atlassian.com/software/views/bitbucket-academic-license.jsp

Strona internetowa

A może chcemy zrobić stronkę (domową, grupy badawczej, czy też konferencji)

Jeśli chcemy na własnym serwerze, niezłą i dość profesjonalną opcją jest
http://wordpress.org/ (albo http://wordpress.com/, jeśli nie mamy własnego serwera)
Przykład: http://cognitivesystems.pl/ (a zresztą, jest na tym sporo międzynarodowych konf. )

Acz też nie jest zły http://www.wikidot.com/, na którym mam większość inicjatyw.
Najnowszy przykład: http://offtopicarium.wikidot.com/

Notatki

Nieliniowe, z strukturą wiki
http://tiddlywiki.com/ (pod Firefoxem)
i trudniejsze: http://gitit.net/

Liniowe, do drobnych rzeczy
Np. http://evernote.com/

(Rzecz jasna, przed papierem nie uciekniecie ;))

Programowanie

Cokolwiek chcecie robić w życiu, uczcie się Pythona:
http://www.python.org/
I otwarty, i łatwy, i potężny, i dość czytelny, i ma wiele bibliotek numerycznych.

A może R? Zatem interaktywnie:
http://tryr.codeschool.com/

I rzeczy, o których zapomniałem na SKFizie

Dropbox - ciągły backup (składuję tam wszystkie pliki, na których aktualnie działam - by zepsucie się dysku, czy też kradzież, nie pociągły za sobą stryczka). Jak ktoś nie ma, to zachęcam - http://db.tt/mt7QY0M

Figshare - dzielenie się wykresami, posterami i innymi rzeczami "mniej niż artykuł" (ale dają nam cytowalnego DOIa!)
http://figshare.com/
Mój przykład: http://figshare.com/authors/Piotr%20Migdal/97685

Dzielenia się prezentacjami:
https://speakerdeck.com/
Mój przykład: https://speakerdeck.com/pmigdal
(jest też bardziej popularny http://www.slideshare.net/, ale wydaje mi się zaśmiecony)

Zaawansowana lista "to do" - http://www.rememberthemilk.com/.

Gierki

http://www.testtubegames.com/velocityraptor.html (i http://www.testtubegames.com/higgs.html)
http://silverspaceship.com/chromatron/
http://gamelab.mit.edu/games/a-slower-speed-of-light/

Unless otherwise stated, the content of this page is licensed under Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 License